· proteingym：深入探索突变效应的强大工具 项目介绍 proteingym 是一个开源项目，旨在为研究人员提供一个全面的深度突变扫描（dms）实验数据集和临床变异数据集。 · 通过在海量未标记的蛋白质序列数据上进行学习，plm 能够捕捉到蛋白质序列的复杂模式和相互作用，这为蛋白质功能的预测、结构分析以及蛋白质-蛋白质相互作用的识别带 … Proteingym is an extensive set of deep mutational scanning (dms) assays curated to enable thorough comparisons of various mutation effect predictors indifferent regimes. Zero-shot dms assay scores. · proteingym 提供了一个全面且强大的工具，用于评估和比较不同的突变效应预测模型。以下是几个推荐使用 proteingym 的理由： 数据集的全面性：proteingym 包含了大量的 … It comprises a large curated collection of 200+ high-throughput … We would like to thank the gemme team for providing model scores on an earlier version of the benchmark (proteingym v0. 1), and the protssn, saprot, poet, mulan, vespag, prosst, … Proteingym is a collection of benchmarks aiming at comparing the ability of models to predict the effects of protein mutations. Proteingym是一个广泛的深度突变扫描（dms）测定集合，旨在使不同情况下的各种突变效果预测器进行全面比较。 它包括两个基准：1）替代基准，包括对87个dms测定中的约1. 5m个错 … The benchmarks in proteingym are divided according to mutation … · proteingym是一组旨在比较模型预测蛋白质突变效应的能力的benchmark数据集，根据突变类型（substitutions，indels）、来源（dms 分析与临床注释）和训练方案（无监督与 … * non-parametric bootstrap standard error of the difference between the spearman performance of a given model and that of the best overall model, computed over 10k bootstrap samples … · proteingym is a benchmark suite for assessing the performance of protein fitness prediction and design models. · proteingym数据集的显著特点在于其大规模和多样性，涵盖了广泛的蛋白质突变实验，为突变效应预测提供了丰富的数据支持。数据集中的每个突变体都经过实验验证，具有明 … 数据集共包含来自 87 个 dms 测序实验的大约 150 万个错义变体。 论文「 enhancing efficiency of protein language models with minimal wet-lab data through few-shot learning 」使用该数据集 …
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· proteingym：深入探索突变效应的强大工具 项目介绍 proteingym 是一个开源项目，旨在为研究人员提供一个全面的深度突变扫描（dms）实验数据集和临床变异数据集。 · 通过在海量未标记的蛋白质序列数据上进行学习，plm 能够捕捉到蛋白质序列的复杂模式和相互作用，这为蛋白质功能的预测、结构分析以及蛋白质-蛋白质相互作用的识别带 … Proteingym is an extensive set of deep mutational scanning (dms) assays curated to enable thorough comparisons...
